Las enfermedades complejas en la región maxilofacial a menudo exigen cirugía. La planificación quirúrgica intenta minimizar la duración de la cirugía para reducir el riesgo de complicaciones. Además de las imágenes, pueden aplicarse técnicas de visualización tridimensional para apoyar el proceso de planificación. Esta representación visual de objetos médicos permite la simulación de procedimientos quirúrgicos antes de la intervención. La mayor ventaja de las tecnologías de esterolitografía de objetos complejos es la reproducción precisa de objetos a partir de un conjunto de elementos tridimensionales como un modelo físico que el cirujano maxilofacial puede ver y tocar.

El prototipado rápido médico también se está desarrollando para su uso en implantes dentales. Se ha logrado una mayor precisión con el uso de guías quirúrgicas de prototipado rápido para crear osteotomías en la mandíbula, y un diseño asistido por ordenador (CAD/CAM) para la fabricación de estructuras dentales parciales.